4种不同拭子释放人细胞DNA效果的研究
【从4种不同拭子释放血痕DNA的结果情况来看,4N6FLOQSwabsTM拭子(copan)得到的DNA含量最高,其他3种拭子所获得的DNA含量相差不大与4N6FLOQSwabsTM拭子相比, 均具有统计学差异(P< 0.05)。
有研究发现采用尼龙植绒阴道拭子能够提高强奸案中精子DNA的检出成功率, 也有报道植绒拭子对脱落细胞的提取效果优于复合纳米棉签拭子。
研究显示, 生物检材采集与保存套管、生物物证提取专用棉签拭子以及普通医用棉签, 这3种拭子释放的DNA量基本持平, 而由4N6FLOQSwabsTM植绒拭子所获得的模板DNA量显著提高。】
两步擦拭法常用于采集犯罪现场发现的血痕、精斑以及人体脱落细胞等生物样本。附着在不同拭子上的人体细胞释放DNA的量有无差异, 拭子上附着的人体细胞DNA保存的时效性如何, 未见有详细报道。为进一步研究现场生物检材采集中常用的拭子释放模板DNA的效率, 本文以5µL全血为研究对象, 选取DNA实验室常用的4N6FLOQSwabsTM植绒拭子、生物检材采集与保存套管、生物物证提取专用棉签拭子以及普通医用棉签等共4种不同拭子, 制备成人体有核细胞数量基本一致的血痕拭子, 应用同一种提取方法提取DNA模板, 采用定量分析法比较不同拭子所释放出的模板DNA量, 并比较同一种血痕拭子随保存时间的延长释放的DNA量有无明显下降。
1 材料与方法
1.1 主要仪器及试剂
4N6FLOQSwabsTM植绒拭子(copan), 生物检材采集与保存套管(广州**实验器材有限公司), 生物物证专用棉签拭子(公安部物证鉴定中心), 普通医用棉签拭子(宁波**药棉有限公司)。
7500荧光定量仪(LT, 美国), 恒温混匀仪(Eppendorf, 德国), Quantifiler® Trio PCR Reagents(LT, 美国), Lysis Buffer(Promega, 美国), 15%硅珠悬液, Elution Buffer(Promega, 美国)。
1.2 血痕拭子制备
1.2.1 实验样本的编号与分组
准备4N6FLOQSwabsTM植绒拭子(尖头带套管)、生物检材采集与保存套管、生物物证提取专用棉签拭子以及普通医用棉签拭子各40根。每种拭子均分为A组与B组(各20根)。A组编号规则为4N6FLOQSwabsTM植绒拭子(尖头带套管)编为A1-1至A1-20号, 生物检材采集与保存套管编为A2-1至A2-20号, 生物物证提取专用棉签拭子编为A3-1至A3-20号, 普通医用棉签拭子编为A4-1至A4-20号; 同样规则对B组编号。
1.2.2 实验样本的制备
采集20名志愿者的静脉血制成EDTA抗凝血, 标记为个体1号至个体20号。在A1-1号拭子、A2-1号拭子、A3-1号拭子、A4-1号拭子、B1-1号拭子、B2-1号拭子、B3-1号拭子及B4-1号拭子的头部各滴1号个体全血5 µ L, 以此类推, 共制备血痕拭子160份。将生物物证提取专用棉签血痕拭子以及普通医用棉签血痕拭子均封装于纸质物证袋内, 另外2种血痕拭子用拭子自带的套管密封封装。制备好的A组样本在室温(25 ℃左右)放置1 d后进行DNA提取; 制备好的B组样本在室温(25 ℃左右)放置30 d后进行DNA提取。
3 方法
1.3.1 样本的DNA提取
样本置于1.5 mL离心管内, 加入Lysis Buffer裂解液400 µ L, 95 ℃裂解30 min, 离心, 将上清液转移至另一干净离心管内, 加入15%硅珠悬液40 µ L后置于恒温混匀仪(25 ℃, 900 r/min)上放置30 min, 70%冷乙醇洗涤2次后挥干残余乙醇, 之后加入Elution Buffer洗脱液30 µ L在56 ℃洗脱10 min, 离心取上清液备用。
1.3.2 样本的DNA定量
采用Quantifiler® Trio PCR Reagents试剂盒在7500荧光定量仪上对DNA模板进行定量。体系为20 µ L, 其中Mix 10 µ L、Primer 8 µ L、DNA模板 2 µ L。荧光定量程序按照Quantifiler® Trio PCR Reagents试剂盒推荐的程序进行。
1.4 统计学分析
采用SPSS 19.0软件, 应用方差分析对不同种类拭子间数据进行统计学处理, 同种拭子组间比较用配对t检验, 数据应用x± s表示, 检验水准α =0.05。
2 结果
2.1 A组样本检验结果定量比较
A组样本中4种不同的拭子释放血痕DNA的结果见表1。4N6FLOQSwabsTM拭子得到的DNA含量最高, 均值为(2.253± 0.775)ng/μ L。其他3种拭子所获得的DNA含量相差不大, 与4N6FLOQSwabsTM拭子相比, 均具有统计学差异(P< 0.05)。
2.2 B组样本检验结果定量比较
制备好的拭子在室温放置30d后B组所有样本的DNA含量均有下降, 但普通医用棉签拭子的DNA含量最低, 其均值只有(0.812± 0.366) ng/µ L, 差异具有统计学意义。生物检材采集与保存套管和生物物证提取专用棉签拭子所提取的DNA含量居中, 二者之间未表现出统计学差异。
2.3 两组中同一种拭子检验结果定量比较
4N6FLOQSwabsTM植绒拭子(尖头)、生物检材采集与保存套管、生物物证提取专用棉签拭子以及普通医用棉签拭子中的每一种拭子均随存放时间的延长而呈现DNA含量的下降, B组样本与A组样本相比, 其DNA含量的下降具有统计学差异。
3 讨论
传统的棉签拭子采用两步擦拭法, 在刑事案件现场生物检材提取中占据重要地位。有研究发现采用尼龙植绒阴道拭子能够提高强奸案中精子DNA的检出成功率, 也有报道4N6FLOQSwabsTM植绒拭子对脱落细胞的提取效果优于复合纳米棉签拭子。不同品牌及不同材质制成的拭子对微量生物检材的提取效率成为DNA工作者关注的热点问题。
本研究显示, 生物检材采集与保存套管、生物物证提取专用棉签拭子以及普通医用棉签, 这3种拭子释放的DNA量基本持平, 而由4N6FLOQSwabsTM植绒拭子(尖头带套管)所获得的模板DNA量显著提高。产生这些差异的主要原因可能是4N6FLOQSwabsTM植绒拭子为尼龙短纤维, 以垂直方式喷涂覆盖固定于拭子尖端, 因而血痕可紧贴于拭子的短纤维表面上, 在裂解过程中细胞就能够更充分完全地被裂解液浸润裂解, 细胞内的DNA可最大化地被释放出来, 从而显著提高了模板DNA的量, 而其他3种拭子均为棉纤维, 是相互缠绕形成的纤维团, 故细胞易被包裹于纤维团内部, 在裂解过程中这些相互缠绕的棉纤维就会阻碍其内部所吸附细胞DNA的有效释放。检验结果提示随着保存时间的延长, 拭子上附着的人体细胞释放模板DNA的得率都显著下降。在4种不同的拭子中, 生物检材采集与保存套管拭子上的DNA含量下降幅度最小, 普通医用棉签拭子上的DNA含量下降最大, 仅余(0.812± 0.366) ng/µ L。4N6FLOQSwabsTM植绒拭子(尖头)在B组拭子中仍表现为DNA含量最高, 但是其DNA量下降的幅度也不可忽视。上述结果表明在现场提取生物检材后及时进行检验可提高DNA的检出率。上述现象或有以下原因:1)生物检材采集与保存套管内含变色硅胶和干燥片2种干燥剂[3], 其将湿润的血痕拭子晾干所用的时间较短, 故可有效防止生物检材的腐败降解; 而普通医用棉签拭子仅被置于普通的纸质物证袋内, 且由于其松散的纤维结构易受外界环境的影响。2)血痕拭子放置30 d后, 红细胞与其他有核细胞在棉纤维或尼龙纤维上粘附的更加牢固, 从纤维上释放的细胞数量就有所下降, 从而导致获得的DNA模板量下降。3)生物物证提取专用棉签拭子与普通医用棉签拭子表面与物证封装袋内部会直接接触, 长时间放置后, 棉签拭子与物证袋表面粘附, 棉签表面的细胞二次转移而造成了拭子上附着细胞的损失。
4N6FLOQSwabsTM植绒拭子(尖头)在拭子头部与杆部有一折痕, 不需要剪刀或镊子就能轻松地使拭子头部脱落于离心管内, 而且尖头的植绒拭子头部设计也能够减少裂解液的使用量。生物检材采集与保存套管虽然拭子头部悬空于套管内, 但需要借助于剪刀将拭子头部棉纤维表面剪取到离心管内, 其操作步骤略显繁琐。生物物证提取专用棉签拭子与普通医用棉签拭子也需要剪取棉签表面, 而若剪刀清洗或消毒不干净, 则还有可能造成检材间的交叉污染。虽然有研究表明不管是植绒拭子还是棉签拭子, 都需要采用适当的提取方法[4]来提高检出率, 但本文采用对微量及疑难生物检材提取都具有优势的硅珠法[5, 6, 7]进行DNA提取, 也仍发现在原始细胞数量基本一致的状态下, 4N6FLOQSwabsTM植绒拭子上附着的人体细胞释放的模板DNA得率最高, 故其在微量生物检材的检验中可显著提高成功率。对于其它3种拭子, 宜根据现场生物检材情况灵活选用(性价比, 方便性等原则)。此外, 为获得最好的检出效果, 应重视检验的时效性。
转自---刑事技术期刊